หลักสูตรควบบัญชีบัณฑิตและมหาบัณฑิต (บูรณาการ) และหลักสูตรควบบริหารธุรกิจบัณฑิต (บูรณาการ) และวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต เป็นนวัตกรรมอุดมศึกษา 5 ปี ตรี-โท ทางการบัญชีและบริหารธุรกิจ หลักสูตรแรกในประเทศไทย

หลักสูตร 5 ปี ตรี-โท ถือเป็นการพลิกรูปแบบการศึกษาด้านบริหารธุรกิจในระดับอุดมศึกษาที่ผ่านการออกแบบมา เพื่อส่งเสริมการเรียนรู้แบบบูรณาการเพื่อผลิตบัณฑิตที่มีความรู้รอบ และรู้สึก ตลอดจนมีจิตสำนึกรับผิดชอบในเรื่องคุณธรรม จริยธรรม และสิ่งแวดล้อมเพื่อออกไปรับใช้สังคม

โครงสร้างทั้งสองหลักสูตรเป็นไปตามเกณฑ์มาตรฐานหลักสูตรของสำนักงานการอุดม ศึกษาทั้งในระดับปริญญาตรีและระดับบัณฑิตศึกษา พ.ศ. 2548 และหลักสูตรด้านบัญชีเป็นไปตามข้อกำหนดของสภาวิชาชีพตามพระราชบัญญัติวิชาชีพบัญชี พ.ศ. 2547 และตามมาตรฐานการศึกษาระหว่างประเทศสำหรับนักบัญชีมืออาชีพ (International Education Standards for Professional Accountants) ที่กำหนดโดยสหพันธ์นักบัญชีระหว่างประเทศ (International Federation of Accountants)

หลักสูตรนี้เป็นหลักสูตรที่ได้รับการออกแบบเนื้อหาและกระบวนการการเรียนการสอนใหม่ทั้งหมด โดยการนำองค์ความรู้ที่สำคัญทางธุรกิจ เศรษฐศาสตร์ และอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องมาประสมประสานกัน และใช้กระบวนการทางธุรกิจ (Business Process) และการตัดสินใจของผู้บริหาร (Managerial Decision-Making) เป็นตัวตั้งแทนการใช้ “ศาสตร์” แต่ละด้านเป็นตัวตั้ง

เนื้อหา และวิธีการเรียนการสอนในหลักสูตรใหม่นี้ มุ่งเน้นการประสมประสานความรู้จากศาสตราจารย์แขนงต่างๆ เพื่อมาใช้ในการแก้ปัญหาและการตัดสินใจในทางธุรกิจ ผ่านการศึกษาในชั้นเรียน การศึกษาอิสระ การฝึกงานและกิจกรรมเสริมหลักสูตรที่นักศึกษาต้องลงมือปฏิบัติ และมีส่วนร่วมอย่างจริงจังในกิจกรรมจริงทางธุรกิจ โดยตั้งอยู่บนพื้นฐานความตระหนักในบทบาทหน้าที่ และความรับผิดชอบที่ธุรกิจพึงมีต่อการพัฒนาเศรษฐกิจของประเทศ และชีวิตความเป็นอยู่ที่ดีขึ้นของประชาชน

การศึกษาในระดับปริญญาตรีมุ่งเน้นให้นักศึกษารู้รอบ ให้นักศึกษาเห็นภาพกว้างและเข้าใจการเชื่อมโยงกันของหน้าที่งานต่างๆ ทางธุรกิจแบบบูรณาการ ปลูกฝังจริยธรรมและสำนึกรับผิดชอบต่อสังคม และปิดท้ายด้วยการฝึกงาน และการจัดทำโครงการอิสระด้านนวัตกรรมทางธุรกิจ เพื่อให้นักศึกษาเข้าใจภาระความรับผิดชอบในโลกของการทำงานจริงก่อนเข้าสู่หลักสูตรปริญญาโท

หลักสูตรในระดับปริญญาโทเป็นหลักสูตรที่เจาะลึกในสาขาวิชาที่นักศึกษาสนใจ โดยมุ่งเตรียมความพร้อมในการไปเป็นผู้บริหารระดับกลางเพื่อรับผิดชอบในด้านบัญชีหรือบริหารธุรกิจ โดยเปิดสาขาวิชาดังนี้

โครงการหลักสูตรควบตรี-โท ทางการบัญชีและบริหารธุรกิจ จะทำการเรียนการสอนตลอดหลักสูตรเป็นเวลา 5 ปี โดยจะศึกษาที่มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ท่าพระจันทร์ ตลอดหลักสูตร

บัณฑิตที่สำเร็จการศึกษาตามหลักสูตรจะได้รับปริญญา 2 ระดับ คือ ได้รับปริญญาตรี เมื่อศึกษาครบตามหลักสูตร 3.5 ปี และได้รับปริญญาโท เมื่อศึกษาต่อเนื่องอีก 1.5 ปี จนครบถ้วนตามหลักสูตร ทั้งนี้ นักศึกษาสามารถที่จะเลือกสำเร็จการศึกษาเฉพาะระดับปริญญาตรี และออกไปทำงานหลังจากผ่านโครงการฝึกงานตามหลักสูตร โดยไม่ศึกษาต่อในระดับปริญญาโทก็ได้

ทั้งนี้ นักศึกษาที่สำเร็จการศึกษาหลักสูตรบัญชีบัณฑิต (บูรณาการ) และหลักสูตรบริหารธุรกิจบัณฑิต (การจัดการแบบบูรณาการ) ที่ได้รับค่าระดับเฉลี่ยสะสมไม่ต่ำกว่า 3.00 สามารถเข้าศึกษาต่อในระดับปริญญาโท โดยไม่ต้องผ่านกระบวนการสอบคัดเลือก สำหรับในกรณีที่นักศึกษาได้รับค่าเฉลี่ยสะสมต่ำกว่า 3.00 และประสงค์จะศึกษาต่อระดับปริญญาโทจะต้องสอบผ่านการคัดเลือกข้อเขียน และการสอบสัมภาษณ์ตามเกณฑ์ที่คณะฯ กำหนด

หลักสูตรควบบัญชีบัณฑิตและบัญชีมหาบัณฑิต (บูรณาการ)

ระดับปริญญาตรี	126 หน่วยกิต
1. วิชาศึกษาทั่วไป (15 วิชา) 2. วิชาเฉพาะ 2.1 ความรู้พื้นฐานทางธุรกิจ (5 วิชา 15 หน่วยกิต) 2.2 ทักษะทางธุรกิจ (13 วิชา 13 หน่วยกิต) 2.3 บูรณาการวิชาชีพบัญชี (12 วิชา 36 หน่วยกิต) 3. วิชาเลือกเสรี (2 วิชา)	30 หน่วยกิต 90 หน่วยกิต 6 หน่วยกิต

ระดับปริญญาโท (เฉพาะแผน ก แบบ ก2)	36 หน่วยกิต
1. วิชาบังคับ (6 วิชา) 2. วิชาเลือก 2.1 เลือกจากกลุ่มวิชาเลือกที่หลักสูตรกำหนด (2 วิชา) 3. วิทยานิพนธ์	18 หน่วยกิต 6 หน่วยกิต 12 หน่วยกิต

ระดับปริญญาโท (เฉพาะแผน ข)
1. วิชาบังคับ (6 วิชา) 2. วิชาเลือก 2.1 เลือกจากกลุ่มวิชาเลือกที่หลักสูตรกำหนด (2 วิชา) 2.2 เลือกจากวิชาอื่น ๆ ในระดับปริญญาโทไม่น้อยกว่า (2 วิชา) 3. การศึกษาอิสระ	18 หน่วยกิต 6 หน่วยกิต 6 หน่วยกิต 6 หน่วยกิต

ระดับปริญญาตรี	120 หน่วยกิต
1. วิชาศึกษาทั่วไป (15 วิชา) 2. วิชาเฉพาะ 2.1 ความรู้พื้นฐานทางธุรกิจ (5 วิชา 15 หน่วยกิต) 2.2 ทักษะทางธุรกิจ (13 วิชา 39 หน่วยกิต) 2.3 บูรณาการกลยุทธ์และการจัดการธุรกิจ (10 วิชา 30 หน่วยกิต) 3. วิชาเลือกเสรี (2 วิชา) 30 หน่วยกิต	30 หน่วยกิต 84 หน่วยกิต 6 หน่วยกิต